Spateo工具包提供多种算法选择，具备三维重建、区域数字化、细胞间相互作用推断、“形态计量向量场”以及用于交互式操作的可视化界面等独特优势。为验证其性能，研究团队以小鼠胚胎和果蝇发育的研究为例，探索三维空间中随时间变化的器官生态形成机制，并构建小鼠胚胎发育的“3D分子全息图”，证实Spateo将显著提高人们对发育过程中器官形成的理解。
如果说以往的时空算法工具包更多的是辅助研究者观察数据，Spateo则具备系统性的统计能力与强大的分析能力。更具创意的是，Spateo的三维重建算法在拓展到两个甚至多个完成重建的三维胚胎的配准工作时，能够自然地捕捉跨时间点的细胞迁移、凋亡和分裂分化事件。该方法在细胞层面完美解决了胚胎形态发生学的关键问题，为后续的形态计量算法奠定坚实基础。
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作者: 印若蓓 2024年11月13日 03:36
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